Die meisten Besucher betreten namibischen Boden auf dem Hosea Kutako International Airport in Windhoek. Der Platz liegt rund 40 Kilometer von der Stadt entfernt, da Windhoek in einem engen Talkessel liegt. Der stadtnahe Eros Flughafen hat keine genügend lange Landebahn für grössere Flugzeuge und wird nur für Domestic Flights benutzt sowie von den lokalen Charterflug Unternehmen.
Derzeit fliegt die nationale Fluglinie Air Namibia mit ihrem einzigen Jumbo Jet viermal wöchentlich im Direktflug von Frankfurt nach Windhoek. Die LTU fliegt ausserdem zweimal pro Woche von Düsseldorf und München nach Windhoek. Alle anderen Airlines - Lufthansa, SAA, KLM, Swiss, British Airways - bedienen Windhoek nur via Johannesburg, was die Reisezeit von rund 10 auf rund 12 Stunden verlängert, oftmals jedoch etwas preiswerter ist.
